FHIR-HL7v2-SQL-Demo

Demonstração pronta para uso de um servidor FHIR no IRIS for Health 2020.2:

• Transformação de mensagens HL7v2 para o servidor FHIR
• Servidor FHIR que pode ser consultado em SQL

Instalando

Clone este repositório

git clone https://github.com/grongierisc/FHIR-HL7v2-SQL-Demo.git

Docker

docker-compose up --build -d

Uso

• Pode-se usar a configuração do postman em misc/fhirhl7v2demo.postman_collection.

Este projeto é um experimento em usar as APIs da OpenAI para responder prompts de usuários no domínio de saúde usando recursos FHIR e codificação em Python.

Ideia do projeto

IA generativas, como os modelos de LLM disponíveis na OpenAI, vem demonstrando impressionante capacidade para compreender e responder à questões de alto nível.

Conversando com um amigo especialista em Machine Learning @Renato Banzai , um dos pontos que ele me passou e que hoje é um dos grandes desafios de Machine Learning das corporações é realizar o deploy de modelos de ML/AI em produção.

Swift-FHIR-Iris

Aplicativo iOS para exportar dados HealthKit para o InterSystems IRIS for Health (ou qualquer repositório FHIR)

Índice

• Objetivo desta demonstração

• Como executar esta demonstração

  • Pré-requisitos
  • Instale o Xcode
  • Abra o projeto SwiftUi
  • Configure o simulador
  • Inicie o servidor InterSystems FHIR
  • Brinque com o aplicativo iOS

• Como funciona

  • iOS
    • Como verificar a autorização para dados de saúde
    • Como se conectar a um repositório FHIR
    • Como salvar um paciente no repositório FHIR
    • Como extrair dados do HealthKit
    • Como transformar dados HealthKit em FHIR
  • Backend (FHIR)
  • Frontend

• Taref

Introdução

Este artigo tem como objetivo explorar como o sistema FHIR-PEX funciona e foi desenvolvido, aproveitando os recursos do InterSystems IRIS.

Agilizando a identificação e o processamento de exames médicos em centros de diagnóstico clínico, nosso sistema visa aumentar a eficiência e a precisão dos fluxos de trabalho de saúde. Ao integrar os padrões FHIR com o banco de dados Java-PEX da InterSystems IRIS, o sistema ajuda os profissionais de saúde com recursos de validação e roteamento, contribuindo, em última análise, para melhorar a tomada de decisões e o atendimento ao paciente.

Fui desafiado a criar um aplicativo de bot do Azure que possa recuperar e publicar dados no IRIS for Health.

Os dados de um paciente já foram registrados no repositório FHIR do IRIS for Health.

O MRN do paciente é 1001. O nome dele é Taro Yamad. (em japonês: 山田 太郎)

Esse bot pode publicar novas leituras de oxímetro como um recurso de observação associado ao paciente.

Exemplo de uso do banco de dados FHIR InterSystems IRIS for Health para efetuar modelagem ML através do InterSystems IRIS IntegratedML

Descrição

IntegratedML é uma ótima funcionalidade para treino/teste e implantação de modelos ML. FHIR é um padrão poderoso para a interoperabilidade de informações da saúde. Esse projeto visa mostrar como utilizar as ferramentas IRIS/IRIS for Health. Por exemplo, as transformações DTL para preparar dados do FHIR para aplicação de modelos ML dentro do IntegratedML.

Oi pessoal!

Só queria compartilhar aqui um post rápido sobre meu projeto para o Grand Prix :)

O FHIR Patient Viewer é uma ferramenta de renderização reativa de página única construída no Vue.js que exibe de maneira amigável os dados retornados de uma chamada /Patient/{id}/$everything feita para um servidor FHIR da InterSystems. No readme, incluí 3 coisas principais: 1. Uma demonstração em vídeo conectando o FHIR Patient Viewer a um servidor sandbox IRIS FHIR (a maneira mais rápida de testá-lo); 2.

Coloquei o Servidor FHIR da InterSystems para trabalhar na HL7 FHIR Connectathon em Baltimore no último final de semana, postando pacotes, usando recursos Rest e interrogando o Guia de Implementação Vulcan. Nós montamos os projetos Real World Data (RWD) e Schedule of Activity (SoA) para o pessoal do Vulcan IG, indo em frente e conectando pesquisa clínica e dados de saúde. Empregamos uma abordagem bastante decente para atender aos requisitos,

Com os colegas da InterSystems (Huy, Russell, Regilo), estávamos responsáveis por dar suporte ao Servidor FHIR e à apropriação de dados para o evento.

Divertido ou não — quão sério é isso?

Os modelos de linguagem grande estão causando alguns fenômenos nos últimos meses. É claro que eu também estava testando o ChatGPT no final de semana passado, para sondar se ele poderia ser um complemento para alguns chatbots de IA "tradicionais" baseados em BERT que eu estava inventando, ou simplesmente os eliminaria. 

Um pensamento me veio à mente enquanto eu fazia os testes. Sendo um pouco teórico ou filosófico, os padrões de interoperabilidade, como HL7 e FHIR, são uma espécie de "linguagem", certo?

Anexei um documento que descreve o produto que desenvolvi chamado NiPaRobotica Pharmacy. Esta é uma interface que desenvolvi que aceita solicitações de dispensa de farmácia e converte os itens de linha no pedido em diálogos de dispensa que são enviados para robôs de farmácia. Implantei a interface em 3 Farmácias Hospitalares, duas das quais tinham 6 robôs que foram dispostos de tal forma que as rampas de dispensação canalizavam os medicamentos para as mesas pelos farmacêuticos sentados em vitrines atendendo 1200 pacientes por dia.

Uma tarefa "grande" ou "pequena" para o ChatGPT?

Eu testei o modelo de programação do GPT da OpenAI há algumas semanas, para ver se ele consegue, por exemplo, fazer algumas transformações de mensagens entre protocolos de saúde. Ele "consegue", em um nível aparentemente razoável. 

Já faz quase 3 semanas, o que é um tempo bastante longo para o ChatGPT, então me pergunto com que rapidez ele cresce e se poderia fazer alguns jobs de engenharia de integração para nós. Por exemplo, ele consegue criar uma ferramenta DTL de COS da InterSystems para transformar o HL7 em uma mensagem FHIR?

Introdução

Este artigo busca explorar o funcionamento e desenvolvimento do sistema FHIR-PEX, aproveitando os recursos do InterSystems IRIS.

Otimizando a identificação e o processamento de exames médicos nos centros de diagnóstico clínico, nosso sistema visa aumentar a eficiência e precisão dos fluxos de trabalho de saúde. Ao integrar os padrões FHIR ao banco de dados Java-PEX do InterSystems IRIS, o sistema ajuda os profissionais de saúde com recursos de validação e roteamento, melhorando, em última análise, a tomada de decisões e o cuidado dos pacientes.

Oi, pessoal!

Recentemente, eu precisava configurar um servidor FHIR local usando o IRIS For Health e acho que encontrei a maneira mais fácil e simples possível.

Basta executar estas duas linhas no terminal:

docker run --rm --name my-iris -d --publish 9091:1972 --publish 9092:52773 intersystemsdc/irishealth-community

e

docker exec -it my-iris iris session iris -U "USER" '##class(%ZPM.PackageManager).Shell("install fhir-server")'

E o servidor FHIR será executado localmente em http://localhost:9092/fhir/r4.

É só isso!

O servidor FHIR usará a última versão do InterSystems IRIS for Health Community Edition e implantará o servidor FHIR a partir desse app pelo pacote IPM no  namespace FHIRSERVER.

Isso se aplica ao Mac, então adicione nos comentários como funciona no Windows.

Esse é um breve artigo, já que é muito fácil configurar um servidor FHIR local com o InterSystems IRIS for Health e o IPM Package Manager.

A especificação do FHIR Terminology Service descreve um conjunto de operações nos recursos CodeSystem, ValueSet e ConceptMap. Entre essas operações, as quatro operações a seguir parecem ser as mais amplamente adotadas:

O desenvolvimento de uma implementação parcial da especificação tem sido uma forma eficaz de explorar o novo framework FHIR introduzido no IRIS for Health 2020.1. A implementação inclui quatro operações listadas acima e oferece suporte a interações de leitura e pesquisa para os recursos CodeSystem e ValueSet.

É importante observar que a implementação usa classes persistentes do Plain ObjectScript como fonte para tabelas de terminologia.

Há 2 anos eu venho utilizando Python embutido diariamente. Talvez seja o momento de compartilhar um feedback sobre essa jornada.

Por que escrever esse feedback? Porque eu acredito que sou como a maioria das pessoas aqui, um desenvolvedor ObjectScript, e penso que a comunidade poderia ter algum benefício desse feedback e entender melhor os prós e contras de escolher Python embutido para desenvolver em IRIS. Além de evitar algumas armadilhas.

• Feedback : Usando Python embutido diariamente por 2 anos
• Introdução
• Começando com Python
  • Python não é ObjectScript
    • Pep8
    • Modulos
    • Dunders
  • Conclusão
• Python Embutido
  • O que é Python embutido?
  • Como usar Python embutido?
  • Como eu uso Python embutido
    • Use libraries e códigos Python como se fossem classes ObjectScript
      • Com a tag de linguagem
      • Sem a tag de lingaugem
      • Conclusão
    • Use uma primeira abordagem Python
      • Exemplo: iris-fhir-python-strategy
      • Observações
      • Onde achar o código
        • Como implementar uma estratégia
        • Implementação de InteractionsStrategy
        • Implementação de interações
        • Interações em Python
        • Implementação da classe abstrata de Python
      • Muito longo, faça um resumo

O FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) é o padrão mais utilizado pelo mercado para interoperar e armazenar dados em saúde. Trata-se de um padrão que mapeia dezenas de recursos de dados (Pacientes, Observações, Medicações, Diagnósticos, Alergias, Vacinas, Faturamento, Provedores de Saúde, Atendimentos, dentre outros) e seus relacionamentos (Medicações do Paciente, por exemplo). O acesso a todas estas estruturas de dados se dá pelo uso de APIs REST em formato JSON ou XML. A princípio, a maioria dos fornecedores de soluções FHIR, não disponibiliza acesso aos dados no formato SQL.

Construção de um repositório FHIR + o servidor de autorização/recurso OAuth2 no IRIS for Health - Parte 2 IRIS para #FHIR #OAuth2 #InterSystems de Saúde Olá, caros desenvolvedores! Neste artigo, vamos focar-nos na OAuth2, um protocolo que é cada vez mais utilizado em combinação com o FHIR para realizar permissões. Nesta parte 1, iniciaremos o contentor Docker para IRIS para a Saúde e Apache, configuraremos a função do servidor de autorização OAuth2 na IRIS for Health, acedemos-lhe a partir da ferramenta de desenvolvimento do Postman REST e obteremos um token de acesso.

Adicione uma credencial para fazer login na interface REST do FHIR — nesse caso, considere apenas uma autenticação básica

Adicione o registro de serviços — nesse caso, considere apenas uma autenticação básica

- configure um serviço HTTP

- insira o caminho para o servidor FHIR

- insira o URL para o serviço FHIR

- use a credencial definida
 

Adicione um "HS.FHIRServer.Interop.HTTPOperation"

Escolha o nome do serviço

Teste o cliente FHIR

Rastreie o resultado do teste

Participei do concurso InterSystems Women’s Health FHIR porque adorei o desafio de aprender uma tecnologia nova para mim. Eu queria desenvolver um aplicativo que recebesse dados de um dispositivo móvel como meu Fitbit ou Smart Watch. Não tive acesso a esses dados, exceto quando baixei uma planilha (arquivo CSV) mostrando meus passos diários e dados de sono. Vi no iris-fhir-template que ele importou alguns dados do paciente para um servidor FHIR.

confiram as sessões de foco em interoperabilidade FHIR ao vivo esta semana.

Introdução

Eu recentemente participei no "mão na massa" fantasticamente organizado pelo @Patrick Jamieson no qual uma aplicação Angular foi configurada junto com um servidor IRIS FHIR seguindo os protocolos definidos pelo SMART On FHIR e eu o achei muito interessante, então decidi desenvolver a minha própria aplicação Angular e então usar o que aprendi e publicar na comunidade.

SMART On FHIR

Vamos ver o que o Google nos conta sobre o SMART On FHIR:

SMART on FHIR é um padrão de dados que permite que aplicações acessem informação em sistemas de registro eletrônico de saúde (EHR).

Sei que pessoas completamente novas no VS Code, Git, Docker, FHIR e outras ferramentas podem, às vezes, ter dificuldades com a configuração do ambiente. Por isso, decidi escrever um artigo que percorre todo o processo de configuração passo a passo para facilitar o início.

Eu realmente agradeceria se você pudesse deixar um comentário no final – me diga se as instruções foram claras, se algo ficou faltando ou se há mais alguma coisa que você acharia útil.

A configuração inclui:

✅ VS Code – Editor de código
✅ Git – Sistema de controle de versão
✅ Docker – Executa uma instância do IRIS for Health Community
✅ Extensão REST Client do VS Code – Para executar consultas à API FHIR
✅ Python – Para escrever scripts baseados em FHIR
✅ Jupyter Notebooks –Para tarefas de IA e FHIR

Antes de começar: Certifique-se de ter privilégios de administrador no seu sistema.

Além de ler o guia, você também pode seguir os passos nos vídeos:

Para Windows

O IRIS oferece suporte nativo para transformações CCDA e FHIR, mas o acesso e a visualização desses recursos exigem tempo considerável de configuração e conhecimento do produto. O aplicativo IRIS Interop DevTools foi desenvolvido para preencher essa lacuna, permitindo que implementadores comecem a utilizar e visualizar imediatamente as capacidades de transformação embutidas no produto.

Olá, desenvolvedores!

Este será um artigo bem curto, pois em abril de 2025, com o Lovable e outras ferramentas Prompt-to-UI, tornou-se possível construir o frontend com prompting. Até mesmo para pessoas como eu, que não estão nem um pouco familiarizadas com as técnicas modernas de UI.

Bem, eu conheço pelo menos as palavras javascript, typescript e ReactJS, então, neste artigo bem curto, construiremos a UI ReactJS para o servidor InterSystems FHIR com Lovable.ai.

Vamos lá!

Você deve ter notado que configurar um mirror (espelho) para InterSystems IRIS for Health™ e HealthShare® Health Connect possui um requisito especial.

Eu queria detalhar este requisito passo a passo neste artigo.

Isto pressupõe que você já configurou o segundo membro de failovere confirmou um status de membro de failover bem-sucedido no monitor do mirror.:

Passo 1: Habilitar o usuário HS_Services (no backup e no primário)

Passo 2: Mudar para o Namespace HSSYS e ir para Interoperabilidade > Configurar > Credenciais.

Nós concluímos essa série de artigos SMART On FHIR com Auth0 e InterSystems FHIR Repository revisando nossa aplicação desenvolvida em Angular 16.

Sabe aquela sensação de receber o resultado do seu exame de sangue e parecer que está em grego? É exatamente esse problema que o FHIRInsight veio resolver. Surgiu da ideia de que dados médicos não deveriam ser assustadores ou confusos – deveriam ser algo que todos podemos utilizar. Exames de sangue são extremamente comuns para verificar nossa saúde, mas, sejamos sinceros, interpretá-los é difícil para a maioria das pessoas e, às vezes, até para profissionais da área que não trabalham em um laboratório. O FHIRInsight quer tornar todo esse processo mais simples e acessível.

No último artigo nós apresentamos a arquitetura do nosso projeto SMART On FHIR, então agora é o momento de colocar a mão na massa e começar a configurar os elementos que vamos precisar. 

Vamos começar com Auth0.

Configuração AUTH0

Vamos começar criando uma conta Auth0 com um email válido. Uma vez registrada, vamos criar nossa primeira aplicação e faremos isso do menu a esquerda:

Em nosso exemplo, a aplicação será do tipo Single Page Web Application, como é uma aplicação desenvolvida em Angular 16. Selecionamos esta opção e clicamos em Create.

Baseado num ótimo exemplo e workshop construído por @Luis Angel Pérez Ramos (veja artigos relacionados e o Open Exchange app relacionado), que incluiu um container local InterSystems for Health (e setup desejado), essa amostra apresentada aqui, adaptada do workshop para usar o InterSystems Cloud FHIR Server, e suas definições relacionadas.